Przedmiotem wynalazku jest nowa metoda detekcji bakterii i grzybów w próbce materiału biologicznego, w którym zawarte DNA poddaje się amplifikacji w reakcji PCR w czasie rzeczywistym w systemie multipleksowym.

Reakcję amplifikacji prowadzi się dwuetapowo z zastosowaniem w pierwszym etapie starterów specyficznych dla bakterii oraz grzybów, a następnie produkt pierwszej amplifikacji wykorzystuje się jako matrycę w drugim etapie – amplifikacji z zastosowaniem starterów i sond różnicujących grzyby na grupę grzybów pleśniowych i drożdżopodobnych i bakterie na Gram dodatnie i Gram ujemne.

Podstawowe zalety metody:

• objęcie całości panelu mikroorganizmów bakteryjnych i grzybiczych, z różnicowaniem na bakterie Gram ujemne, Gram dodatnie, grzyby drożdżopodobne i grzyby pleśniowe, lecz bez typowania konkretnych gatunków;
• jednoczesna amplifikacja co najmniej 2 sekwencji DNA, co pozwala na jednoczesną detekcję bakterii i grzybów, bez oczekiwania na wynik elektroforezy DNA;
• zastosowanie systemu Nested pozwala na zwiększenie czułości metody detekcji o dwa rzędy wielkości w porównaniu do PCR jednostopniowego;
• możliwość wykorzystania metody do wykrywania tylko bakterii lub tylko grzybów, lub do jednoczesnego wykrywania zarówno grzybów jak i bakterii, co wpływa na obniżenie kosztów badania.
• możliwość wytypowania konkretnego gatunku drobnoustroju po sekwencjonowaniu produktu PCR.

Kontakt z Brokerem Technologii
Centrum Transferu Technologii CITTRU, Uniwersytet Jagielloński

Klaudia Polakowska

tel. +48 12 663 38 32

e-mail: klaudia.polakowska@uj.edu.pl